宫颈癌(CC)是妇科第三大常见癌症和第四大致死原因，但其确切进展尚不明确，主要是由于肿瘤发生的不同阶段肿瘤微环境变化的高度复杂性所致。重要的是，缺乏对CC患者不同阶段肿瘤微环境(TME)的详细比较单核转录分析。
图片来源：https://doi.org/10.1186/s13046-023-02598-0
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近日，来自佛山市第一人民医院的研究者们在J Exp Clin Cancer Res杂志上发表了题为“Single-nucleus RNA sequencing and deep tissue proteomics reveal distinct tumour microenvironment in stage-I and II cervical cancer”的文章，该研究为破译CC的进展提供了重要的资源，并为开发诊断CC和治疗免疫抑制的TME的新方法奠定了基础。
在这项研究中，从I期和II期CC患者的肿瘤组织中提取了42,928和29,200个核，并进行了单核RNA测序(SnRNA-seq)分析。利用生物信息学工具对细胞异质性和功能进行比较研究。此外，还进行了基于无标记定量质谱学的蛋白质组学分析。比较I期和II期CC患者的蛋白质组图谱，并与SnRNA-seq进行整合分析。
与I期CC(CCI)患者相比，II期CC(CCII)患者多种免疫细胞中与免疫反应相关的信号通路受到抑制，但与细胞和组织发育相关的信号丰富，线粒体相关基因上调提示代谢产生能量。这与定量蛋白质组学分析显示CCII组TME中促进细胞生长和细胞间基质发育的蛋白质占主导地位是一致的。
在脑梗塞患者的许多细胞群体中，干扰素-α和γ反应出现了最活跃的通路。在CCII组中发现COL12A1、COL5A1、COL4A1和COL4A2等几种胶原蛋白显著上调，提示它们在诊断CC进展中的作用。一个新的转录本AC244205.1被检测到是CCII患者中最上调的基因，其在CC中的可能机制可能被进一步研究。
CCI患者TME中肿瘤相关干细胞(TASCs)和上皮细胞的免疫反应更为活跃
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在这项研究中，我们用SnRNA-seq和无标记定量蛋白质组学方法比较研究了I期和II期CC患者的TME。结果表明，II期CC患者几乎所有免疫细胞，包括MΦs、T细胞、B细胞、NK细胞和树突状细胞的异质性受到很大程度的调节，其表型具有明显的免疫抑制作用。相比之下，这些细胞在I期CC患者中表现出高免疫反应，其中干扰素-α和γ反应是最活跃的信号通路。几个组蛋白显示了在早期诊断CC的潜力。
值得注意的是，对于II期CC患者，多种细胞类型的SnRNA-seq分析和蛋白质组分析分别鉴定出胶原蛋白的显著上调，提示它们可能作为预后标志物。首次揭示了新转录本AC244205.1的异常表达与II期CC的相关性。这些发现为CC的临床诊断和免疫治疗提供了重要线索，值得进一步研究。（生物谷 Bioon.com）
参考文献
Xiaosong Liu et al. Single-nucleus RNA sequencing and deep tissue proteomics reveal distinct tumour microenvironment in stage-I and II cervical cancer. J Exp Clin Cancer Res. 2023 Jan 23;42(1):28. doi: 10.1186/s13046-023-02598-0.
