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胃腺癌(GAC)是世界上第五大最常见的癌症，总死亡率仅次于肺癌和结直肠癌。尽管包括免疫治疗在内的治疗方法取得了进展，但晚期胃腺癌患者的预后仍然较差。胃癌的发生发展是一个由基因组和表观基因组改变驱动的多步骤过程，这些改变导致胃上皮细胞的转化，进而导致癌细胞的生长和侵袭。GAC是一种高度异质性的疾病，其临床结局包括总体生存、早期复发和用药耐受。因此，将GACs分为临床和分子亚组可以显著改善治疗结局。许多研究者在通过各种方法建立此类分类方面付出了相当大的努力。然而，在将分子亚型转化为临床实践方面仍有相当大的差距。
近段时间德克萨斯大学安德森癌症中心的一个研究团队对之前确定的GAC亚型进行了一项荟萃分析，以发现共同的致癌/免疫原性分子改变，从而更好地选择治疗靶点和识别预测预后或治疗反应的可靠生物标志物。
该团队通过整合之前建立的8个GAC亚型的基因组标签，确定了6个临床和分子上不同的基因组共识亚型(CGSs)。其中CGS1预后最差，具有非常高的干细胞特性、高IGF1表达；CGS2富集典型上皮基因表达。CGS3和CGS4具有高拷贝数改变和低免疫反应性。但CGS3和CGS4的不同之处在于，CGS3具有高HER2激活，而CGS4具有高SALL4和KRAS激活。CGS5具有较高的突变负担和适度高免疫反应性微卫星不稳定的肿瘤的特征。大多数CGS6肿瘤Epstein Barr病毒阳性，并表现出极高水平的甲基化和高免疫反应性。在对基因组和蛋白质组学数据进行的系统分析中，研究人员估算了各共识亚型对标准和实验性治疗(如放疗、靶向治疗和免疫治疗)的潜在缓解率。有趣的是，由于CGS3的基础铁死亡（一种调节性细胞死亡形式）水平高，因此CGS3与放化疗的获益显著相关。
6种GAC共识亚型预测亚型的表达模式
总之，该研究确定了6种临床不同的GAC共识亚型，每一种亚型在分子和基因组上都是同质的。此外，与这6个亚型相关的遗传和表观遗传改变将为开发新的胃腺癌干预措施提供机会，该发现的潜在标记基因在PDX模型中得以保存，为这一背景提供了有价值的资源。
原始出处：Jeong YS, Eun YG, et al. Clinically conserved genomic subtypes of gastric adenocarcinoma. Mol Cancer. 2023 Sep 6;22(1):147. doi: 10.1186/s12943-023-01796-w. PMID: 37674200.
