项目背景
(资料图片仅供参考)
时空组学技术是近年来发展迅猛的新兴技术,它不仅能够定量检测细胞的基因表达,还能精确定位细胞在组织中的空间位置,实现了从时间、空间维度深度解析健康和疾病状态下细胞类型和基因表达的变化过程。
华大时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发的可实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术,它将认识生命空间的分辨率提高到了500 nm的亚细胞层级。相比国际同类技术分辨率提升了40000倍,最大视野提升了400倍。目前,Stereo-seq已被成功应用到胚胎和器官发育、再生医学、肿瘤研究等多个领域,截至目前,已在Cell、Science、Nature等顶级学术期刊发表近30篇文章,并入选了2022年度“中国生命科学十大进展”和“中国生物信息学十大进展”。
为推动时空组学这一前沿工具的应用,助力青年科学家科学发现的产出,华大生命科学研究院于2022年推出“第一期临床转化研究青年科学家激励计划”,受到了广泛关注,并为最终入选的25个项目提供了支持。今年,以时空组学疾病研究为特色的西南华大生命科学研究院,联合重庆高新区管委会科技创新局,共同发起面向中国地区科研人员的“第二期临床转化研究青年科学家激励计划”。研究人员仅需提交利用华大时空组学STOmics®进行临床转化研究的计划书,即有机会获得资源支持。
为了更好地赋能临床青年科学家,第二期激励计划在第一期的基础上增加了更满足临床需求的H&E+转录组、mIF+转录组技术,为深入研究组织结构、病理分型等提供了有力支持。此外,入选项目可以免费体验时空云平台STOmics Cloud,通过云平台对项目数据及工具进行高效整合,可大大提高多组学数据分析效率,加速科研进程,助力临床转化。
活动内容
该计划将支持各个疾病领域科学家利用时空组学技术开展临床转化研究。您可以通过提交合作项目计划书参加评选,内容不限疾病(动物模型研究、临床队列研究均可)。评审委员会最终评选出具有临床转化潜力的10个计划书,同时为提出这10个项目的科学家提供免费时空组学STOmics®项目支持(包含测序和基础分析服务)。
招募项目研究内容包括但不限于以下领域:
临床应用与转化的探索
聚焦肿瘤演变过程,多层次、多尺度地探讨肿瘤异质性、微环境,揭示肿瘤发生、发展、转移和复发规律,寻找系统性抗肿瘤策略,为临床诊疗提供鉴别诊断、分子分型新方向的理论依据。
1) 项目要求:与肿瘤生物学事件相关的科学探索,包括肿瘤发生、发展的分子机制,肿瘤微环境分析前沿算法开发,肿瘤多模态数据算法开发等;
2) 样本要求:新鲜包埋的冰冻样本。
药物研发
利用时空多组学技术在药物研究的动物模型中探索肿瘤药物靶点调控机制、靶点空间/组织学特征关系、耐药形成机制、药代动力学、安全性等;
1)项目要求:包括抗肿瘤、慢行疾病、细胞治疗等药物临床前研究,研究对象为模式动物模型、3D类器官等;
2)样本要求:新鲜冰冻组织。
肿瘤空间分子标记物的探索
基于肿瘤治疗的临床试验,利用多组学、多维度的方法探索与治疗响应、复发、转移相关的空间分子特征,提供病人分层的新标准和新途径;
1) 项目要求:①与恶性实体瘤治疗疗效相关的临床试验;②参加临床试验患者的入组条件明确;③临床试验主要指标(primary outcome)、主要终点事件(primary endpoint)、次要指标(secondary outcome)等信息在半年内可及;
2) 样本要求:新辅助治疗、辅助治疗前、治疗过程中的穿刺样本,新鲜包埋的冰冻样本,样本内含有70%以上肿瘤细胞。
申请要求
▶提交项目相关信息,简述利用时空组学STOmics®解决的临床科学问题、实验设计方案及临床转化前景。
▶请在项目信息中明确您想检测的物种、样本组织类型、样本数量以及该项目是否属于伴随诊断 (CDx)和/或临床试验的一部分。
▶保密及产权。活动发起者对申请者提供的研究方案进行严格保密,并对数据具有共享权,但不可用于文章发表及公开。合作方与华大共享时空数据,均有权完成自主分析。在隐去项目信息前提下,华大有权将自主分析结果用于对外展示(不公开原始数据)及后续宣传。对于入选项目会签署数据共享相关协议。
▶申请资格。目前在国内高校、研究院、医院、药企等单位任职或学习,从事相关工作的科研人员。
项目支持
最终的10个入选项目,将由华大生命科学研究院专家组成的评审委员会评审公布。每个入选项目可获得由华大时空提供的2~4个免费的时空服务(1 cm*1 cm标准芯片,可选转录组、H&E+转录组、mIF+转录组等技术,其中mIF由入选项目提供抗体),涵盖组织切片制备、文库构建、测序及基本数据分析流程。
关键节点
申请时间
即日起-2023年6月30日
结果公布
2023年7月31日
查询方式
获奖名单将在华大时空的微信公众号公布,同时主办方通过电子邮件通知获奖者。
报名方式
报名即将结束!6月30日前,扫描下方二维码,或点击“阅读原文”,提交您的信息及申请材料。
扫描二维码,提交报名信息
关于西南华大生命科学研究院
西南华大生命科学研究院由华大集团和重庆高新区管委会合作共建,聚焦前沿生命科学和临床问题,以全球领先的时空组学为核心,以生物信息为支撑,以临床需求为导向,持续提升在生命健康领域的源头创新能力,建设国际领先的时空组学研究平台,推动生命科学基础创新研究、临床应用和产业转化融合发展。
*活动最终解释权归主办方所有。
联系我们
华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,是全球领先且能同时实现“纳米级分辨率和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术。它将认识生命空间的分辨率提高到了500nm的亚细胞层级,相比国际同类技术提升了40,000倍,视野大小提升了400倍,可全面应用于生老病死、意识起源、万物生长、生命起源等重大问题研究,将推动继显微镜和DNA测序技术以来的生命科学领域第三次科技革命。截至目前,已在Cell、Nature、Science等顶级学术期刊发表近30篇文章。
如果您对华大时空组学技术 Stereo-seq 感兴趣,可发送信息至邮箱:services@stomics.tech。